Вербовка постоянной агентуры — вот важнейшая отличающая любой спецслужбы, она пришла в Россию с Тайной канцелярией. По воспоминаниям свидетелей Петровской эпохи, обычной платой доносчикам и тайным осведомителям была десятка, десять русских рублей — наш отечественный эквивалент тридцати библейским сребреникам. В зависимости от важности расследуемого дела эта сумма варьировалась. Когда в 1722 году в церквах Москвы появились подметные листовки с критикой Петра и его политики, Тайная канцелярия объявила в своих уличных указах награду в тысячу рублей за указание автора этих воззваний. Это огромная по тем временам для России сумма, для усиления эффекта такого соблазна будущих доносчиков эти деньги были вывешены на столбах одной из московских площадей, для чего потребовалось целых десять мешков по сто рублей в каждом. Несмотря на такую щедрость сыска, найти злоумышленника так и не смогли, даже в тайном сыске не все решают только деньги.
Одним из важнейших отличий петровской Тайной канцелярии от отлученного от сыска Преображенского приказа стала более четкая документализация политического розыска. Правильное оформление политического следствия на бумаге стало не менее важным делом, чем само выбивание признаний в злодейских умыслах. Тайный сыск понемногу велением времени шел от примитивно карательных своих форм типа опричников или царских приказов к институту государственной спецслужбы. В него при Тайной канцелярии впервые в России пришла бюрократия и делопроизводство, да и вообще эпоху реформ Петра считают зарождением российской бюрократии, которую принесли многочисленные иностранцы на русской службе взамен произволу бывших воевод, опричников с метлами у седла и дьяков из различных приказов.
Нельзя не заметить и того, как принципиально отличается петровская Тайная канцелярия от черновых проектов опричнины или Тайного приказа в плане поставленных перед ней задач. Если опричники или дьяки Тайного приказа работали непосредственно по указу царя против людей и движений, в чем-то его не удовлетворявших, оставляя без своего внимания тысячи жителей России вне пределов внимания монарха, то Тайная канцелярия изначально создавалась для контроля за всем обществом. Пусть формально она находилась только в Санкт-Петербурге и имела один свой филиал в Москве, не обладая сетью своих отделов по всей остальной России. Но Петр приказал уже своим губернаторам и чиновникам на местах в деле политической безопасности отчитываться перед представителями Тайной канцелярии, а в случае обнаружения признаков государственной измены или заговора в провинции — прекращать самостоятельное следствие и направлять арестованных в столичную Тайную канцелярию, не считаясь с затратами на такую транспортировку. По идее Петра I, его спецслужба со временем должна была взять под колпак всю территорию империи, став полностью профессиональной спецслужбой и отвечая за госбезопасность на всем протяжении страны.
Еще одним важным отличием Тайной канцелярии Петра от преображенцев или Тайного приказа его отца Алексея Михайловича стала работа против первой идейной оппозиции царю, а не стихийных народных мятежников типа Разина и взбунтовавшихся астраханцев или религиозных раскольников. Одним из первых настоящих и идейных оппонентов царской власти в России и политических диссидентов многие считают Степана Посошкова, чей памфлет «О скудости и богатстве» считается первым спором с властью именно в идейно-политической плоскости. Задолго до французских якобинцев, наших декабристов или Радищева этот сын простого купца написал политический трактат с осуждением жестокостей самодержавной власти и требованиями послабления народу, о котором в «О скудости и богатстве» сказано: «В поборах за гривну из человека хотят душу вытянуть, а где тысячи погибают, того немало смотрят и не радеют о том». Впервые в России появилась книга, ставящая так откровенно вопрос: имеет ли право власть в интересах государства пренебрегать интересами отдельного человека? Мимо такого вызова власти петровский сыск пройти не мог.
Делом Посошкова занималась Тайная канцелярия, и это можно считать первой расправой с российским диссидентом, поскольку спор с властью стоил впоследствии Посошкову жизни. В 1725 году по обвинению в выступлении против власти Посошкова забрали в Тайную канцелярию, где вскоре после допросов он скончался в камере. Это было одно из первых зафиксированных в истории сыска дел, когда власти человек оппонировал идеями, оформленными в книге, а не бунтом или церковным расколом. Посошкова можно было бы назвать трибуном общества, если можно вообще в петровской империи говорить о каком-то обществе. Скорее в абсолютистском тогда царстве была власть, и было подконтрольное ей население страны. Поэтому и первые российские политические диссиденты мирно-дискуссионного направления были одиночками, с организованным общественным протестом российскому сыску при Романовых придется столкнуться значительно позднее.
Это касается осознанных диссидентов, так сказать, идеологически подкованных и имевших идейную базу для спора с властью по политическим и моральным вопросам. Потому что отчасти диссидентами можно считать и тех многочисленных и безвестных нам, в отличие от Посошкова, российских бунтарей и стихийных спорщиков с властью, своего рода анархистов начала XVIII века. Таких, как допрашиваемый в Тайной канцелярии в 1719 году крестьянин Семен Полуектов, заявивший при народе свою «политическую программу»: «Я вольный человек и государя не боюсь». Или арестованный в том же году подьячий Постников, выстреливший из ружья в царский герб, укрепленный на крыше кабака. И в материгялах Тайной канцелярии не раз встречаются такие персонажи с приписками: «Плюнул на царский указ», «Призвал царский указ использовать в нужнике по назначению», «Бросил на пол монету с царским ликом», «Сказал: государя не боюсь, и никого не боюсь кроме Бога», «Говаривал: греб я всех государей» и т. д. Таких российских подданных были тогда десятки и сотни, судя по этим материалам Тайной канцелярии. Иногда такой протест был просто хулиганской выходкой или акцией под влиянием хмельных паров, под расследование Тайной канцелярии попавшей только в силу тогдашнего подхода сыска к любому проявлению неуважения к власти или личности царя. Но это все равно другая сторона по отношению к книге Посошкова одного процесса: спора отдельной личности с властью о пределах диктата одного над другим.
И еще об одном отличии Тайной канцелярии от примитивных предшественников стоит упомянуть. Ей впервые официально поручено дело контрразведки в Российской империи, надзор за нахождением в России иностранных подданных и целенаправленная работа против действия в России разведчиков иностранных государств. До создания Тайной канцелярии контрразведка, как и внешняя разведка, в России велась стихийно. Искоренять «изменников» (часто мнимых) поручали и опричникам, и преображенцам, и различным чашничим и окольничим еще до романовской власти в России. В алексеевском Тайном приказе дьяки присутствовали при встрече государем иностранных послов, приглядывали за их дворами в Москве и сопровождали русских дипломатов в их посольствах за границу для присмотра за ними. Иностранных агентов, разоблаченных и репрессированных в России, из числа иноземцев или служивших им русским, было предостаточно. Но не было еще такого централизованного органа, которому контрразведывательная деятельность поручалась в качестве отдельной и постоянной задачи.