1919, 6 февраля — Особый отдел ВЧК при СНК РСФСР.
1922, 6 февраля — Особый отдел ГПУ при НКВД РСФСР.
1923, 2 ноября — Особый отдел ОГПУ при СНК СССР.
1934, 10 июля — Особый отдел ГУГБ НКВД СССР.
1936, 25 декабря — 5-й отдел ГУГБ НКВД СССР.
1938, 9 июня — Управление особых отделов (Второе управление) НКВД СССР.
29 сентября — 4-й отдел (Особый отдел) ГУГБ НКВД СССР.
1941, 8 февраля — Третье управление НКО СССР.
Третье управление НК ВМФ СССР.
Третий отдел НКВД СССР.
17 июля — Управление особых отделов НКВД СССР.
1943, 19 апреля — ГУКР «Смерш» НКО СССР (Главное управление контрразведки «Смерш» Народного комиссариата обороны СССР).
УКР «Смерш» НК ВМФ СССР (Управление контрразведки «Смерш» Народного комиссариата Военно-морского флота СССР).
ОКР «Смерш» НКВД СССР (Отдел контрразведки «Смерш» Народного комиссариата внутренних дел СССР).
1946, 25 февраля — ГУКР «Смерш» НК ВС СССР (Главное управление контрразведки «Смерш» Народного комиссариата Вооруженных сил СССР).
3 марта — ГУКР «Смерш» МВС СССР (Главное управление контрразведки «Смерш» Министерства Вооруженных сил СССР).
4 мая — Третье главное управление МГБ СССР.
1953, 14 марта — Третье управление МВД СССР.
1954, 13 марта — Третье главное управление КГБ при СМ СССР.
1960, 5 февраля — Третье управление КГБ при СМ СССР.
1978, 7 июня — Третье управление КГБ СССР.
1982, 25 мая — Третье главное управление КГБ СССР.
1991, 22 октября — Главное управление ВКР МСБ СССР (Главное управление военной контрразведки Межреспубликанской службы безопасности СССР).
26 ноября — УВКР АФБ РСФСР (Управление военной контрразведки Агентства федеральной безопасности РСФСР).
1992, 24 января — УВКР МБ РФ (Управление военной контрразведки Министерства безопасности РФ).
1993, 21 декабря — УВКР ФСК РФ (Управление военной контрразведки Федеральной службы контрразведки России).
1995, 3 апреля — УВКР ФСБ РФ (Управление военной контрразведки Федеральной службы безопасности России).
1997, 6 июня — УВКР ДКР ФСБ РФ (Управление военной контрразведки Департамента контрразведки ФСБ России).
1998, 10 августа — УВКР ФСБ РФ (Управление военной контрразведки ФСБ России).
2000, 7 февраля — УВКР (Третье управление) ФСБ РФ (Управление военной контрразведки ФСБ России).
2004, 4 августа — ДВКР (3-й департамент) ФСБ РФ (Департамент военной контрразведки ФСБ России).
Руководители военной контрразведки
Михаил Сергеевич Кедров (январь-август 1919 года);
Феликс Эдмундович Дзержинский (август 1919 — июль 1920 года);
Вячеслав Рудольфович Менжинский (июль 1920 — июль 1922 года);
Генрих Григорьевич Ягода (июль 1922 — октябрь 1929 года);
Ян Калистович Ольский (октябрь 1929 — июль 1931 года);
Георгий Евгеньевич Прокофьев (август — октябрь 1931 года);
Израиль Моисеевич Леплевский (ноябрь 1931 — февраль 1933 года; ноябрь 1936 — июнь 1937 года);
Мирон Ильич Гай (июнь 1933 — ноябрь 1936 года);
Николай Галактионович Николаев-Журид (июнь 1937 — март 1938 года);
Леонид Михайлович Заковский (март — апрель 1938 года, по совместительству);
Николай Николаевич Федоров (май — ноябрь 1938 года);
Виктор Михайлович Бочков (ноябрь 1938 — август 1940 года);
Анатолий Николаевич Михеев (август 1940 — июнь 1941 года);
Виктор Семенович Абакумов (июнь 1941 — май 1946 года);
Николай Николаевич Селивановский (май 1946 — ноябрь 1947 года);
Николай Андрианович Королев (ноябрь 1947 — декабрь 1950 года);
Яков Афанасьевич Едунов (январь 1951 — февраль 1952 года);
Сергей Арсеньевич Гоглидзе (февраль 1952 — март 1953 года, по совместительству); (март — июнь 1953 года);
Дмитрий Сергеевич Леонов (июнь 1953 — июнь 1959 года);
Анатолий Михайлович Гуськов (июнь 1959 — февраль 1963 года);
Иван Анисимович Фадейкин (февраль 1963 — февраль 1966 года);
Георгий Карпович Цинев (февраль 1966 — июль 1967 года);
Виталий Васильевич Федорчук (июль 1967 — июль 1970 года);
Иван Лаврентьевич Устинов (сентябрь 1970 — ноябрь 1973 года);
Николай Алексеевич Душин (февраль 1974 — июль 1987 года);
Василий Степанович Сергеев (июль 1987 — ноябрь 1990 года);
Александр Владиславович Жардецкий (ноябрь 1990 — август 1991 года);
Юрий Емельянович Булыгин (октябрь 1991 — январь 1992 года);
Алексей Алексеевич Моляков (январь 1992 — декабрь 1997 года);
Владимир Иванович Петрищев (декабрь 1997 — сентябрь 2000 года).
Биографии руководителей военной контрразведки
Михаил Сергеевич Кедров (1878–1941) родился в Москве в семье нотариуса; из дворян. Учился в Демидовском юридическом лицее (Ярославль).
В 1897 году исключен «за беспорядки» с юридического факультета Московского университета. Член РСДРП с 1901 года. Передал РСДРП полученное наследство — 100 тысяч рублей золотом, закупив на эти деньги оружие и устроив в Петербурге оружейную мастерскую; на Невском проспекте открыл типографию, в которой выпускал сборник работ Ленина «За 12 лет», за что был арестован. После освобождения в 1911 году уехал в Швейцарию, окончил медицинский факультет Бернского университета. Возвратившись в Россию в 1916 году, был призван в армию военврачом, воевал на Кавказском фронте, вел пропаганду среди солдат.
В 1917 году — член Всероссийского бюро военных организаций при ЦК РСДРП(б), редактор газет «Солдатская правда» и «Рабочий и солдат». С ноября 1917 года — заместитель наркома по военным делам, комиссар по демобилизации старой армии. В мае 1918 года направлен командующим войсками Северо-Восточного участка завесы; руководил борьбой с контрреволюцией в Архангельске, где разогнал городскую думу, арестовав меньшевиков и эсеров. Широко применял репрессии, из-за чего вступил в конфликт с местными органами советской власти. Организованная им оборона Архангельска оказалась неудачной, город был оккупирован английскими войсками.