Таблица 53 Частота аллелей ApoE в европейской популяции
Вариант *4 связан с повышенным уровнем общего холестерина и в-липополипротеинов, а также со снижением антиоксидантной клеточной активности.
Этот вариант указывает на риск развития сердечно-сосудистых заболеваний и болезни Альцгеймера. Генотип *4/*4 встречается у долгожителей.
Генетический маркер риска нарушени обмена варфарина – полиморфизмы R144C С-> (CYP2C9*2) и I359L (CYP2C9*3) ген цитохрома CYP2C
Анализ полиморфизма R144C C->T (CYP2C9*2) гена цитохрома CYP2C9 помогает определить риск онкологических заболеваний, подобрать оптимальную дозу лекарств (варфарина, аценокумарола, толбутамида, лозартана, глипизида, фенитоина, ибупрофена) при антикоагуляционной терапии, а также оценить вероятность развития патологии у потомства.
Исследование полиморфизма R144C C->T (CYP2C9*2) гена CYP2C9 рекомендуется при:
• плановом назначении варфарина;
• кровотечениях, связанных с приемом варфарина, у больного или его родственников (I и II степени родства);
...
Риск полиморфизма Т/Т у потомства: при генотипе обоих родителей Т/Т – 100%, при генотипе родителей Т/Т и С/Т – 50%, при генотипе обоих родителей С/Т – 25%.
• невынашивании беременности;
• отслойке плаценты и других осложнениях, связанных с беременностью.
Результаты исследования:
• С/С – нормальный полиморфизм в гомозиготной форме;
• С/Т – гетерозиготная форма полиморфизма;
• Т/Т – мутантный вариант полиморфизма в гомозиготной форме.
Генетический маркер риска развития остеопороза – полиморфизм 13910 С/Т гена лактазы (LPH)
Анализ полиморфизма 13910 С/Т гена лактазы (LPH) помогает выявить лактозную непереносимость и оценить риск развития остеопороза.
Аминокислотную последовательность лактазы кодирует ген LPH. Лактаза вырабатывается в тонком кишечнике и участвует в расщеплении лактозы – молочного сахара. Лактаза, как правило, присутствует в организме детей. У некоторых взрослых этот фермент перестает вырабатываться. В этом случае употребление молочных продуктов приводит к расстройствам пищеварения. Человек отказывается от молочных продуктов, что часто приводит к дефициту кальция в организме. Это крайне неблагоприятно для женщин, находящихся в постменопаузе, поскольку приводит к развитию остеопороза.
Исследование полиморфизма 13910 С/Т гена лактазы (LPH) рекомендуется при:
• непереносимости молочных продуктов;
• определении риска развития остеопороза;
• оценке вероятности непереносимости молочных продуктов у детей старше 1,5 года.
Результаты исследования:
• С/С – нормальный вариант полиморфизма в гомозиготной форме. Непереносимость лактозы у взрослых;
• С/Т – гетерозиготная форма полиморфизма;
• Т/Т – мутантный вариант полиморфизма в гомозиготной форме. Хорошая переносимость лактозы у взрослых.
На выработку лактазы у взрослых влияет полиморфизм 13910 С/Т гена лактазы (LPH). При этом нормальный вариант полиморфизма С связан со снижением выработки лактазы у взрослых, а мутантный вариант Т – с сохранением повышенного синтеза этого фермента. Получается, что в организме гомозиготных носителей варианта С лактоза не усваивается, тогда как носители гомозиготоного варианта Т спокойно питаются молочными продуктами.
Установление биологического родства
Для разрешения спорных случаев биологического происхождения детей проводят молекулярно-генетическое исследование. Его целью является установление родственных связей между предполагаемыми родителями (отцом или матерью) и ребенком или, напротив, их исключение. Генетическое установление родства основано на принципах хранения и передачи наследственной информации, которая записана в молекуле ДНК.
ДНК присутствует в ядре каждой клетки организма человека и находится в хромосомах. В каждой клетке имеется по 22 пары хромосом, которые называются аутосомами, и по 2 половые хромосомы. При этом одну из парных хромосом человек получает от матери, а другую – от отца. Половые хромосомы ребенок тоже получает от родителей: Х-хромосому от матери, а Y-хромосому (рождается мальчик) или Х-хромосому (рождается девочка) от отца.
...
Для установления биологического родства из биоматериала (в большинстве лабораторий у обследуемых лиц берут анализ крови) выделяют ДНК, а затем с помощью локус-специфичной ПЦР искусственно увеличивают в миллионы раз число копий аллелей по исследуемым локусам. После этого копии аллелей разделяют и идентифицируют, сравнивая аллели ребенка и предполагаемых родителей.
На хромосомах, полученных от родителей (гомологичных хромосомах), расположен двойной комплект генов – тех участков ДНК, на которых записан код организма.
В ДНК есть еще и другие участки, которые ничего не кодируют. При этом в каждой гомологичной паре хромосом гены и пустые участки ДНК находятся в одних и тех же местах – локусах. Правда, последовательность расположенных в одних и тех же локусах нуклеотидов может различаться. Неодинаковые последовательности, расположенные в локусах отцовской и материнской хромосом, называются аллелями. Человек с одинаковыми аллелями является гомозиготным по данным локусам, а тот, у которого аллели отличаются, – гетерозиготным.
Как правило, локусы представлены двумя различными аллелями, но у людей одному и тому же локусу могут соответствовать десятки аллелей. Аллели, которые в большом разнообразии присутствуют у людей, называют высокополиморфными. Чем больше исследуется локусов с высокополиморфными аллелями, тем точнее становится молекулярная картина человеческого организма.
...
Генетический анализ на установление биологического родства следует отложить, если кому-либо из обследуемых в последние 6 месяцев проводилась трансплантация мозга или переливание крови.
При установлении материнства или отцовства исследуется максимальное количество локусов с высокополиморфными аллелями. В генотипе ребенка в любом из исследуемых локусов одна из аллелей всегда совпадает с аллелью, полученной от матери, в другой – с аллелью, полученной от отца. На этом и основывается методика генетического исследования биологического родства – аллели ребенка сравнивают с аллелями предполагаемых родителей. Если в анализе ребенка отсутствуют как минимум две аллели, совпадающие с аллелями предполагаемого родителя по одноименному хромосомному локусу, родство исключается.
В большинстве лабораторий для установления биологического родства используют анализ STR-локусов – участков ДНК длиной от 2 до 5 нуклеотидов. Эти участки могут повторяться. При этом число повторов может отличаться в аллелях для однотипных локусов. Аллели STR-локусов являются высокополиморфными, и установление отцовства (материнства) по ним снижает вероятность случайных совпадений генетических данных у обследуемых людей, поскольку таких локусов очень много.