Важная миссия была возложена на 23-ю дивизию войск НКВД по охране железнодорожных сооружений. Соединение обеспечивало перевозку грузов и людей по льду Ладожского озера, по «Дороге жизни». Сформированные войсками НКВД автоколонны в более чем трудных, смертельно опасных условиях непрерывных атак авиации противника не прекращали боевую службу ни днем, ни ночью, охраняли дорогу от диверсионных групп врага и расхитителей ценных продуктов продовольствия, необходимых голодающему городу. Личный состав также охранял и сопровождал грузы по Кировской железной дороге с западного берега Ладоги до Ленинграда, охранял грузы на железнодорожных станциях, на складах в самом городе [7].
Приказом командования войск внутренней обороны от 11 апреля 1942 года на части 1‑й бригады НКВД была возложена задача по обороне северо-западной части Ленинграда с возведением новых и ремонтом всех видов инженерных сооружений в районах обороны батальонов. Одновременно с проведением мероприятий по совершенствованию обороны приказом командования Ленинградским фронтом от 18 апреля на части НКВД была возложена задача по подготовке к действиям на случай высадки десантов или диверсионных групп противника. С целью совершенствования системы управления войсками в блокадном городе или его окрестностях Ленинград был разделен на участки и районы. Части 1‑й бригады получили задачу подготовить противодесантную оборону на территории 5 участков города. Соединению в оперативном отношении были подчинены все войсковые части Красной Армии и части пожарной службы, находящиеся в данном районе или на участке. Для удобства управления все эти разрозненные силы и средства были порайонно сведены в полки, отдельные батальоны и роты противодесантной обороны участка. Командованием 1‑й бригады была разработана «Временная инструкция по борьбе с воздушным десантом противника в районе 5‑го участка противодесантной обороны г. Ленинграда». Инструкция потом была разослана по всем районам. В соответствии с требованиями наставления в каждом штабе участка создавались оперативные резервные группы, на вооружении которых находились в полной боевой готовности дежурные станковые пулеметы. Вся эта работа проводилась во взаимодействии с системой местной противовоздушной обороны и войсками ПВО.
С левого фланга обороны 1‑й бригады, в четвертом боевом секторе, для отражения нападения десанта противника готовился конвойный полк войск НКВД, с такой же задачей справа к обороне готовился 438‑й стрелковый полк Красной Армии. Личный состав 1‑й бригады войск НКВД подготовил для обороны 5 боевых секторов с батальонными районами обороны и системой ДОТов и ДЗОТов, которые потом были заняты для обороны 61‑м, 62‑м, 64‑м и 104‑м отдельными батальонам войск Ленинградского фронта [7–1]. Однако во время боевых действий на подступах к Ленинграду и блокадные дни не было случаев появления десантов противника в городе и окрестностях, как и не было зафиксировано ни единого эпизода диверсий и высадки диверсионно-разведывательных групп.
В составе войск Западного фронта в боях на Березине участвовали части 42‑й бригады войск НКВД, в районе ст. Капцевичи — 18‑й пограничный отряд, в районе населенного пункта Обликушки — 13‑й пограничный отряд, в обороне городов Невель и Адрианополь — 85‑й пограничный полк, в районе населенного пункта Борк — 53‑й полк по охране железнодорожных сооружений, на окраине города Мценск — 34‑й полк тех же войск, в районе города Боровск — 2‑й мотострелковый полк войск оперативного назначения.
На Юго-Западном фронте в обороне городов Рава Русская, Перемышль и Ровно участвовали 233‑й конвойный, 92‑й и 98‑й пограничные полки. 94‑й полк вел бои в районе населенных пунктов Софино, Раевка [8].
В полном составе в боях под Харьковом участвовала 57‑я бригада по охране особо важных предприятий промышленности. 20 октября 1941 года бригада в оперативном отношении была подчинена командованию 38‑й армии. По его приказу она заняла район обороны Харькова по линии населенных пунктов Алексеевка, Сов. Пост, Холодная Гора. Бригада в ходе оборонительных боев выполнила поставленные перед ней задачи. При этом важно подчеркнуть: в боях за Харьков 57‑я бригада войск НКВД находилась в подчинении Комитета обороны города и командования 30‑й стрелковой дивизии до 6 декабря, затем была переподчинена командованию 13‑й армии для обороны в районе ст. Дон, с 25 декабря перешла в подчинение 3‑й армии Брянского фронта. Столь частые переподчинения, переброски с одного участка обороны на другой, беспрерывное участие в боях без компенсации боевых потерь со стороны командования соединений и объединений Красной Армии было делом обычным для частей и подразделений войск НКВД. После вывода из боя от них нередко оставались одни наименования. Тенденция, к сожалению, сохранялась все годы войны.
Во время приближения фронта к охраняемым объектам, боевые действия вели отдельные гарнизоны 23‑й, 24‑й, 25‑й, 26‑й и 31‑й дивизий войск НКВД по охране железнодорожных сооружений [9].
Значительное количество войск НКВД СССР приняли участие в 70-дневной обороне Киева. На дальних и ближних рубежах столицу Украины защищали части и подразделения 76‑й мотострелковой бригады войск оперативного назначения, 4‑й, 5‑й и 10‑й дивизий по охране железнодорожных сооружений, 13‑й дивизии конвойных войск, 57‑й и 71‑й бригад по охране особо важных предприятий промышленности, личный состав 91‑го, 92‑го, 93‑го, 94‑го пограничных полков [10].
На юге страны бои с противником вели в полном составе отдельные соединения и части. Так, в сражениях за Крым участвовали 184‑я стрелковая дивизия войск НКВД по охране особо важных предприятий промышленности, под Севастополем — сводный полк войск НКВД, в обороне Одессы — личный состав 249‑го полка 13‑й дивизии конвойных войск и 26‑го пограничного полка, в составе Приморской армии — сводный полк НКВД [11].
На подступах к Ростову боевые задачи выполняли части 36‑й дивизии и 71‑й бригады, личный состав 23‑го полка конвойных войск, 114‑го полка 4‑й дивизии, 95‑го полка пограничных войск, 59‑го полка по охране железнодорожных сооружений, 33‑го полка войск оперативного назначения, 113‑го отдельного батальона войск оперативного назначения [12].
Наибольшая группировка войск НКВД участвовала в боевых действиях под Москвой. На различных рубежах подступы к столице в боях с немецко-фашистскими захватчиками приняли участие подразделения, части и соединения всех видов войск НКВД СССР: ОМСДОН, 2‑я ОМСДОН, 34‑й мотострелковый полк оперативного назначения, личный состав 53‑го, 73‑го, 76‑го, 79‑го полков 3‑й дивизии войск по охране железнодорожных сооружений; 115‑й, 125‑й полки 5‑й дивизии, 158‑й, 159‑й, 160‑й, 164‑й, 169‑й, 196‑й и 199‑й полки 12‑й дивизии, 156‑й, 180‑й полки и 115‑й отдельный батальон 69‑й бригады войск НКВД по охране особо важных предприятий промышленности; части 36‑й дивизии и 42‑й бригады конвойных войск, 16‑й отряд и отдельный батальон пограничных войск, 73‑й отдельный бронепоезд 19‑й дивизии войск по охране железнодорожных сооружений, другие части и соединения.