Также владыка Лука канонизирован как местночтимый святой Красноярской епархией РПЦ. В 2000 г. святитель-хирург Архиерейским собором Русской православной церкви прославлен как исповедник (пострадавший за веру, но промыслом Божьим выживший) в сонме новомучеников и исповедников российских. Дни памяти – 29 января, 29 мая (по Юлианскому календарю). Почитается как святой другими поместными церквями, в частности Элладской.
В 2001 г. из Греции в Симферополь привезли серебряную раку для его мощей. 14 июля 2008 г. стал (посмертно) почетным гражданином Переславля-Залесского. Создано «Общество православных врачей России» имени профессора Войно-Ясенецкого.
Украинской православной церковью учрежден Орден святителя Луки Крымского.
Интересно, что толчок к юридической реабилитации незаконно репрессированного ученого дал его внук, доктор экономических наук, председатель комитета Государственной Думы России В.А. Лисичкин. В апреле 2000 г. последовала полная реабилитация В.Ф. Войно-Ясенецкого по четырем открытым против него (в 1923, 1924, 1930, 1937 гг.) уголовным делам
[1028].
Для увековечения памяти святителя-хирурга сделано немало:
• в Российском национальном медико-хирургическом центре имени Н.И. Пирогова создана клиника гнойно-септической хирургии им. В.Ф. Войно-Ясенецкого (Архиепископа Луки) и поставлен ему памятник;
• Красноярский государственный медицинский университет носит имя профессора В. Ф. Войно-Ясенецкого;
• имя хирурга присвоено городской больнице Тамбова;
• памятник свт. Луке установлен в г. Симферополе, при доме, где он жил, воздвигнута часовня, а на территории Свято-Троицкого женского монастыря действует музей о жизни и деятельности святителя-хирурга со множеством принадлежавших ему вещей;
• установлены памятные доски в клиниках Красноярска и Тамбова, в военном госпитале Симферополя;
• функционирует церковь в Одесском национальном медицинском университете и часовня святителя Луки в 3-й городской больнице Одессы.
На корпусах Киевского национального медицинского университета имени А.А. Богомольца установлены памятные доски свт. Луке. Экспонаты, повествующие о деятельности славного выпускника альма-матер, архиепископа Луки Крымского, представлены в музее истории этого учебного заведения. Образ святителя-хирурга занял достойное место в Портретной галерее выдающихся ученых Национального медицинского университета имени А.А. Богомольца, созданной в 2009 г.
Все дети профессора пошли по его стопам и стали медиками. Сыновья Михаил и Валентин (1913–1992, видный патологоанатом) – доктора медицинских наук; Алексей – доктор биологических наук, дочь Елена – врач-эпидемиолог. Внуки и правнуки тоже стали учеными. Кандидат медицинских наук Войно-Ясенецкая Ольга Валентиновна (1942–2001) стала создателем Одесского областного патологоанатомического бюро, Войно-Ясенецкий Алексей Михайлович – профессор-уролог, директор Центра урологии. Правнучка Татьяна – врач-реаниматолог.