1997 — Москва, посольство Швеции. Вооруженный пистолетом и гранатой террорист захватил в автомобиле шведского торгового представителя Яна-Улофа Нюстрема. В результате переговоров тот был освобожден, а его место занял полковник А. Н. Савельев, предложивший себя в заложники. После того как у него случился острейший сердечный приступ, приведший в итоге к смертельному исходу, было решено незамедлительно начать активную фазу операции. В результате перестрелки преступник был уничтожен. Посмертно начальник штаба группы «Альфа» полковник Анатолий Николаевич Савельев был удостоен звания Героя России.
2000 — Новогрозненский, Чечня. Захват Салмана Радуева, главаря «армии Джохара Дудаева», осуществленный сотрудниками группы «А» в составе сводной оперативно-боевой группы Центра специального назначения ФСБ. Благодаря согласованным действиям разведки и спецназа охранники «террориста № 2» были разоружены, а сам он арестован.
2001 —Алхан-Кала, Чечня. Сотрудники «Альфы» участвовали в полномасштабной специальной операции по уничтожению банды одного из наиболее кровавых полевых командиров — Арби Бараева, отличавшегося маниакальной жестокостью и специализировавшегося на похищении людей и работорговле. В операции были задействованы сотрудники ЦСН, разведчики из 46-й бригады внутренних войск МВД, подразделения Министерства обороны. В результате скоротечного, но жестокого боя бандит и его охранники были уничтожены. При этом погиб рядовой Евгений Золотухин (посмертно удостоен звания Героя России).
11 июля 2001 г. — Майртуп, Чечня. Уничтожение одного из ближайших подручных Хаттаба — полевого командира Абу Умара, руководившего в 1990-х гг. учебным лагерем по подготовке диверсантов-взрывников на окраине Сержень-юрта в так называемом институте «Кавказ». Убитый являлся одним из организаторов взрывов жилых домов в сентябре 1999 г. в Москве и Волгодонске и многих других терактов. Первоначальный досмотр дома, где скрывался террорист, ничего не дал. Бойцы «Альфы» уже были готовы перейти в другой двор, как один из них бросил взгляд на показавшуюся ему подозрительной ступеньку деревянной лестницы. Спецназовцы заняли позиции вокруг дома. Когда один из офицеров отодрал половицу, то из-под лестницы ударили автоматные очереди. Сотрудник «Альфы» был ранен, но его товарищи уничтожили засевшего в укрытии Абу Умара. Большую роль в успехе операции сыграли бойцы отряда «Русь», которые двумя группами десантировались в селе в непосредственной близости от места, где находился бандит, и не дали ему уйти в горы.
2001 — Минеральные Воды. Террористом Султаном Саид Эдиевым, чеченцем по национальности, был захвачен автобус «Икарус», следовавший рейсом Невинно-мысск — Ставрополь. Террорист выдвинул требование об освобождении тридцати с лишним пассажиров в обмен на пятерых преступников, осужденных в 1994 г. за захват пассажирского самолета в Минеральных Водах. В нагрудный карман рубашки террорист поместил стакан с боевой гранатой Ф-1 с выдернутой чекой, вставленной запалом вниз. Кроме того, были замечены провода, идущие к поясу на животе. Как оказалось, там находилось полтора килограмма литого тротила. В результате безупречно проведенной снайперской атаки террорист был уничтожен. В ходе штурма автобуса никто из заложников не пострадал.
23—26 октября 2002 г. — Москва, Театральный центр на Дубровке. Группа террористов во главе с М. Бараевым, собравшись в Москве, взяла в заложники около 800 зрителей, актеров и работников Театрального центра на Дубровке. Бандиты требовали прекратить боевые действия в Чечне и угрожали обрушить здание с помощью размещенных в зале мощных взрывных устройств. Благодаря предпринятым действиям, еще до активной фазы несколько десятков человек из числа заложников были спасены сотрудниками спецназа ФСБ. Преступники вели себя крайне агрессивно, от их рук в зале погибло несколько человек. Во избежание массовых жертв было принято решение провести спецоперацию силами Центра специального назначения ФСБ. В результате операции был уничтожен 41 террорист, в том числе главарь группы Мовсар Бараев, освобождено более 750 заложников, из них 60 иностранцев. Более 120 человек спасти не удалось.
8 апреля 2004 г. — станица Шелковская, Чечня. Ликвидация ученика Хаттаба и одного из ближайших подручных Ш. Басаева — Абу-Бакара Висимбаева. Среди прочего этот полевой командир отвечал за вербовку «черных вдов» для совершения акции на Дубровке. В ходе операции погиб сотрудник «Альфы» майор Юрий Николаевич Данилин. Посмертно ему присвоено звание Героя России.
2004 — Беслан. Хорошо вооруженные террористы «полковника» Ортсхоева по приказу главарей террористов захватили 1 сентября свыше 1300 заложников в здании школы № 1 и расстреляли часть из них. Всего же в результате этого чудовищного теракта погибло около 350 человек, половина из них — дети. Свыше пятисот было ранено. Во время штурма бойцами «Альфы» (старший — начальник управления «А» В. Н. Винокуров) был уничтожен 31 террорист и один бандит захвачен живым. 3 сентября в 13 ч 05 мин в здании школы прозвучали два мощных взрыва. Проявив исключительное мужество и героизм, сотрудники ЦСН принялись под пулями спасать заложников, прикрывая их собой, и только потом приступили к методичному уничтожению засевших в школе террористов, которые оказали ожесточенное сопротивление.
В результате боя все бандиты были уничтожены на месте. Спасая заложников, погибли три сотрудника «Альфы» — майор Александр Валентинович Перов, майор Вячеслав Владимирович Маляров, прапорщик Олег Вячеславович Лоськов, а также семеро бойцов «Вымпела».
2005 — Толстой-Юрт, Чечня. Уничтожение лидера Ичкерии Аслана Масхадова. Операция по задержанию лидера сепаратистов, а также его ближайшего окружения планировалась долго и тщательно. В начале марта 2005 г. была получена информация, позволяющая определить адрес, где скрывается террорист со своей охраной. Несмотря на все ухищрения, бункер с лидером террористов был обнаружен. Находившимся в нем террористам было предложено сдаться, на что они ответили категорическим отказом. После чего оперативно-боевые группы провели мероприятие по их задержанию.
2006 год — Хасавюрт, Республика Дагестан. Ликвидация представителя «Аль-Каиды» и главаря всех иностранных боевиков, одного из руководителей и финансистов «джихада» в Чечне и сопредельных регионах Абу Хавса. Вместе с ним были уничтожены четверо боевиков. Силовая фаза операции началась с того, что на рассвете одна из групп намеренно обнаружила себя. Двоих боевиков тут же уничтожили снайперы. По воротам был произведен выстрел из гранатомета, а вслед за этим на бронированном автомобиле КамАЗ ворвалась штурмовая группа. Остававшиеся в живых бандиты заняли оборону. Предложение сдаться они отвергли. Через полчаса все было кончено.
ОРГАНИЗАЦИЯ
Первоначально группа состояла из 30 человек.
С 10 ноября 1977 г. — 52, с 10 января 1980 г. — 122, с 21 декабря 1981 г. — 222 человека.
30 июня 1984 г. приказом председателя КГБ № 0085 было сформировано первое региональное подразделение группы «А» — 7-е отделение в Хабаровске (21 сотрудник). 3 марта 1990 г. приказом № 0031 оно было развернуто в 7-ю группу, а также созданы 10-я группа (Киев), 11-я группа (Минск), 12-я группа (Алма-Ата), 13-я группа (Краснодар) и 14-я группа (Свердловск). Штат региональной группы составлял 45 человек.