Именно с подачи Юрия Андропова было организовано Пятое управление КГБ, задачей которого была «организация контрразведывательной работы по борьбе с акциями идеологической диверсии на территории страны».
Управление было организовано решением Политбюро от 17 июля 1967 года, для работы в нем были направлены руководящие партработники, имевшие опыт идеологической работы. Первым начальником Пятого управления стал партийный работник А.Ф.Кадашев. В мае 1969 года на эту должность пришел профессиональный чекист, бывший зам. начальника Четвертого, Второго главного и Пятого управлений КГБ, Ф.Д.Бобков.
После проведенных Юрием Андроповым серии преобразований структура центрального аппарата КГБ СССР имела следующий вид.
Первое Главное управление КГБ СССР — внешняя разведка (создано 18 марта 1954 года).
Второе Главное управление КГБ СССР — внутренняя безопасность и контрразведка (создано 18 марта 1954 года, к 1980 году в его структуре имелось 17 отделов):
Управление «А» (аналитическое);
Управление «II» — (с сентября 1980 года по 25 октября 1982 года) — «защита интересов обороноспособности и экономического развития СССР»;
Управление «Т» — обеспечение безопасности на транспорте — (создано в сентябре 1973 года) оперативное МГТС> Мнисвязи, Минморфлота, Минрыбхоза, Минречфлота, МГА Министерства гражданской авиации (МГА), Центрального аппарата ДОСААФ и их объектов; организация контрразведывательной работы на железных дорогах, по линии международных, авиационных, морских и автомобильных перевозок, обеспечения специальных и особо важных перевозок.
Самостоятельные отделы:
1-й отдел (США и Латинская Америка),
2-й отдел (Великобритания и страны Британского Содружества),
3-й отдел (ФРГ, Австрия и страны Скандинавии),
4-й отдел (Франция и остальные страны Европы),
5-й отдел (Япония, Австралия),
6-й отдел (развивающиеся страны),
7-й отдел (туристы),
8-й (остальные иностранцы),
9-й отдел (студенты),
10-й отдел (журналисты, служба безопасности таможни),
отдел по борьбе с терроризмом.
Третье Главное управление КГБ СССР — военная контрразведка (создано 18 марта 1954 года, с февраля 1960 года до июня 1982 года — Третье управление).
В состав Третьего управления входили Особые Отделы в военных округах,
Управление Особых Отделов в Ракетных войсках Стратегического Назначения,
Особые Отделы в войсках ПВО страны,
Особые Отделы в ВВС,
Особые Отделы в ВМФ,
Управление особых отделов по внутренним войскам МВД СССР — создано 13 августа 1983 года,
Управление «В» (контроль органов МВД) — создано 13 августа 1983 года для контрразведывательной защиты органов МВД. Ранее в соответствие с решением Политбюро ЦК КПСС от 27 декабря 1982 года на укрепление аппарата МВД из КГБ было командировано более 100 офицеров из «числа опытных руководящих оперативных и следственных работников».
Четвертое управление КГБ СССР — обеспечение государственной безопасности на транспорте (ликвидировано 5 февраля 1960 года, его функции с 25 июля 1967 года по сентябрь 1973 года выполнял 12-й отдел Второго Главного управления, а с сентября 1973 года и по сентябрь 1981 года Управление «Т» Второго Главного управления), восстановлено 10 сентября 1981 года приказом КГБ СССР № 00170 от 10 сентября 1981 года (структура и штат были объявлены приказом КГБ СССР № 00175 от 24 сентября 1981 года).
Пятое управление КГБ СССР — идеологическая контрразведка (приказ КГБ СССР № 0096 от 25 июля 1967 года).
Шестое управление КГБ СССР — экономическая контрразведка и промышленная безопасность (ликвидировано 5 февраля 1960 года; восстановлено решением Коллегии КГБ «О мерах по усилению контрразведывательной работы по защите экономики страны от подрывных действий противника» — объявлено приказом КГБ СССР № 00210 от 25 октября 1982 года). Структура и штат Шестого управления были объявлены приказом КГБ СССР № 00215 от И ноября 1982 года. Ранее эти задачи решали 9-й, 11-й и 19-й отделы Второго главного управления, а с сентября 1980 года — Управление «П» в составе этого главка.
Седьмое управление КГБ СССР — наружное наблюдение и охрана иностранного дипломатического корпуса (создано 18 марта 1954 года):
служба ОДП (охрана дипломатического корпуса);
группа «А» (образована Приказом Председателя КГБ № 00890В от 29 июля 1974 года) службы ОДП — группа «Альфа» (подчинялась напрямую председателю КГБ и Генеральному секретарю КПСС);
7-й отдел (материально-техническое обеспечение средствами наружного наблюдения: автомобили, телекамеры, фотоаппаратура, магнитофоны, зеркала);
10-й отдел (наблюдение за общественными местами, посещаемыми иностранцами: парками, музеями, театрами, магазинами, вокзалами, аэропортами);
11-й отдел (снабжение аксессуарами, необходимыми для ведения слежки: париками, одеждой, гримом);
12-й отдел (наблюдение за высокопоставленными иностранцами).
Восьмое Главное управление КГБ СССР — шифровальная служба (создано в марте 1954 года).
Девятое управление КГБ СССР — охрана руководителей партии и правительства (создано 18 марта 1954 года):
Управление коменданта Московского Кремля (с 18 марта 1954 года по 25 июня 1959 года — Десятое управление КГБ);
Комендатура по охране зданий ЦК КПСС.
Пятнадцатое Управление КГБ СССР — строительство и эксплуатация «резервных объектов» — бункеров для руководства страной в случае ядерной войны. Создано путем выделения из состава Девятого Управления КГБ (приказ КГБ № 0020 от 13 марта 1969 года). Согласно временному Положению об этом подразделение Лубянки (объявлено Приказом КГБ № 0055 от 1 июня 1971 года): «…Основной задачей Управление является обеспечение постоянной готовности к немедленному приему укрываемых в защищаемые пункты (объекты) и создание в них условий, необходимых для нормальной работы в особый период». Свою работу Пятнадцатое управление должно было осуществлять «в тесном взаимодействие с Девятом управлением КГБ».
Шестнадцатое Управление КГБ СССР — электронная разведка, радиоперехват и дешифровка (выделено 21 июня 1973 года из Восьмого управления приказом КГБ СССР № 0056 от 21 июня 1973 года):
1-й отдел — вскрытие шифров. В своем распоряжение имел специальную машину оборонного назначения (разработка московского НИИ «Квант» первой половины семидесятых годов прошлого века) ЭВМ «Булат». Хотя ресурсов этого устройства не хватало. Работа по анализу собранной информации, особенно на местах, велась, как рассказал в 2000 году журналисту Евгению Пахомову один из бывших сотрудников Шестнадцатого управления, главным образом «вручную»: «Мы и мечтать не смели о том, чтобы, как американцы, отправлять каждый перехват на компьютерный анализ. Я помню эти длинные ряды шкафов, набитых пыльными папками с подшитыми, но не расшифрованными материалами. По сути, мы работали в шкаф»;